More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4053 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  74.59 
 
 		 580 aa  753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  83.91 
 
 		 580 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  100 
 
 		 578 aa  1098    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  100 
 
 		 578 aa  1098    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  100 
 
 		 578 aa  1098    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  84.26 
 
 		 580 aa  856    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  54.4 
 
 		 603 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  55.76 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  53.44 
 
 		 580 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  55.16 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  56.06 
 
 		 546 aa  482  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  53.14 
 
 		 573 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  47.29 
 
 		 591 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  47.74 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  47.75 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  46 
 
 		 562 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  48.15 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  65.98 
 
 		 505 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  54.14 
 
 		 498 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  53.85 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  54.07 
 
 		 492 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  52.83 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  69.59 
 
 		 495 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  50 
 
 		 693 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  30.54 
 
 		 584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  32.33 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  30.2 
 
 		 584 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.08 
 
 		 659 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  30.62 
 
 		 665 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  30.17 
 
 		 664 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  30.14 
 
 		 584 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  30.74 
 
 		 665 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.84 
 
 		 518 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.81 
 
 		 538 aa  153  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.47 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.95 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  29.16 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.2 
 
 		 637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.08 
 
 		 570 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.5 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.68 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.68 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  30 
 
 		 546 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  31.55 
 
 		 528 aa  140  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  32.57 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  29 
 
 		 683 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  26.44 
 
 		 568 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  31.5 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  27.12 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 687 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  31.27 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  40.49 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.5 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.11 
 
 		 672 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  28.44 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  29.04 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  31.27 
 
 		 582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.37 
 
 		 687 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  28.26 
 
 		 672 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  31.83 
 
 		 591 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  30.09 
 
 		 598 aa  117  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  29.59 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  28.46 
 
 		 726 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  26.62 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 572 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  31.16 
 
 		 590 aa  115  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  37.85 
 
 		 515 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  29.13 
 
 		 572 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  29.46 
 
 		 567 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  36.04 
 
 		 661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  26.52 
 
 		 681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  35.71 
 
 		 584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  35.38 
 
 		 661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  37.8 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  28.33 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.34 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  35.38 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  29.97 
 
 		 593 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  27.93 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  34.88 
 
 		 553 aa  112  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  29.14 
 
 		 703 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 678 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  36.98 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  38.83 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  30.06 
 
 		 619 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.41 
 
 		 530 aa  110  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 722 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  39.2 
 
 		 554 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  36.13 
 
 		 559 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  29.12 
 
 		 551 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  37.42 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  37.42 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  36.63 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  37.42 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  34.83 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  37.42 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>