More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2096 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  100 
 
 		 590 aa  1162    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  33.61 
 
 		 576 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  34.06 
 
 		 584 aa  290  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  32.84 
 
 		 576 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  32.84 
 
 		 576 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  32.45 
 
 		 665 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  33.28 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  33.02 
 
 		 584 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  27.9 
 
 		 693 aa  206  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  34.4 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  32.74 
 
 		 580 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  48 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  44.64 
 
 		 577 aa  192  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  31.16 
 
 		 591 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  51.91 
 
 		 563 aa  188  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  44.69 
 
 		 552 aa  187  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  45.05 
 
 		 554 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  44.59 
 
 		 552 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  44.59 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  44.59 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  48.72 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  46.67 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  44.25 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  46.15 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  44.14 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  48.21 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  43.36 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  32.45 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  29.53 
 
 		 603 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  43.36 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  43.36 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  43.36 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.54 
 
 		 539 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  44 
 
 		 515 aa  180  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  50.27 
 
 		 554 aa  180  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  44.13 
 
 		 552 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  47.8 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.59 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1314  SSS sodium solute transporter superfamily  48.65 
 
 		 522 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  44.59 
 
 		 572 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  46.39 
 
 		 552 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  46.46 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  39.34 
 
 		 513 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1155  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.65 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.409917  normal  0.213123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  45.88 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.97 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3287  acetate permease  45.85 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  45.19 
 
 		 577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  38.03 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  43.5 
 
 		 661 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  44.88 
 
 		 666 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  39.54 
 
 		 516 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  30.56 
 
 		 580 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  39.54 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.37 
 
 		 575 aa  173  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  39.54 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  39.54 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  37.68 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  39.16 
 
 		 516 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.65 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  40.69 
 
 		 561 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  40.69 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  31.38 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  39.16 
 
 		 516 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  45 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  48.35 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  39.16 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.11 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  43.94 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.8 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  48.7 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  50.55 
 
 		 561 aa  171  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  40.26 
 
 		 564 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  45 
 
 		 584 aa  171  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  38.61 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  50.53 
 
 		 562 aa  171  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  48.35 
 
 		 553 aa  171  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.55 
 
 		 561 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  44.79 
 
 		 664 aa  170  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  51.96 
 
 		 576 aa  170  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.18 
 
 		 524 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  51.96 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  35.56 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  40.69 
 
 		 561 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  44.91 
 
 		 553 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  40.69 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  44.75 
 
 		 537 aa  169  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>