More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1063 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  100 
 
 		 614 aa  1163    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  52.99 
 
 		 575 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  50.44 
 
 		 580 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  50.88 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  50.27 
 
 		 580 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  48.18 
 
 		 562 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  48.64 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  50.45 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  46.56 
 
 		 591 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  40.66 
 
 		 693 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  52.84 
 
 		 546 aa  422  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  48.21 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  48.21 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  48.72 
 
 		 580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  48.21 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  46.44 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  46.01 
 
 		 603 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  43.26 
 
 		 579 aa  332  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  54.96 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  51.96 
 
 		 492 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  50.38 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  58.55 
 
 		 505 aa  210  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  45.67 
 
 		 498 aa  210  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  57.07 
 
 		 495 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  30.61 
 
 		 590 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  30.27 
 
 		 637 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.91 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.37 
 
 		 560 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 576 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.22 
 
 		 575 aa  148  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 665 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  30.12 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  30.12 
 
 		 576 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  26.56 
 
 		 571 aa  144  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  27.14 
 
 		 572 aa  143  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  27.5 
 
 		 683 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  28.46 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  27.98 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  28.46 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.77 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  26.6 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  26.47 
 
 		 568 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.04 
 
 		 518 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  27.61 
 
 		 683 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 687 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.16 
 
 		 687 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  27.2 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.74 
 
 		 582 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  26.46 
 
 		 681 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  23.99 
 
 		 567 aa  126  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  25.73 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.38 
 
 		 672 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  26.67 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  26.29 
 
 		 688 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 672 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  28.44 
 
 		 582 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  26.86 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  28.62 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  27.52 
 
 		 516 aa  122  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  26.57 
 
 		 614 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  25.42 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  30.16 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  26.34 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 578 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  26.52 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.6 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  24.49 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  24.49 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  24.49 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  35.57 
 
 		 563 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  35.57 
 
 		 563 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 572 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  36.57 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.22 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  38.22 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  29.14 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  26.25 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  39.07 
 
 		 577 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  35 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.31 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.81 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 594 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  37.66 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  35.57 
 
 		 553 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.51 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  36.31 
 
 		 561 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  27.96 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  24.85 
 
 		 703 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  38.41 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>