More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2860 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  100 
 
 		 562 aa  1076    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  70.56 
 
 		 591 aa  732    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  55.39 
 
 		 551 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  49.29 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  50 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  47.64 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  48.18 
 
 		 614 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  49.19 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  45.89 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  45.89 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  45.89 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  46.28 
 
 		 580 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  45.65 
 
 		 580 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  46.77 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  45.29 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  42.96 
 
 		 603 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  40.93 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  49.48 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  48.4 
 
 		 492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  57.22 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  39.92 
 
 		 693 aa  186  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  55.94 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  53.3 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  44.03 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  29.39 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  28.31 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  29.03 
 
 		 551 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  28.28 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  28.65 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  27.88 
 
 		 637 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  29.97 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  29.36 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  29.33 
 
 		 549 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  28.08 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  29.33 
 
 		 549 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  29.33 
 
 		 549 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  29.33 
 
 		 549 aa  166  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  27.32 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  29.33 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  29.22 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.86 
 
 		 659 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  29.14 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  27.49 
 
 		 554 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  29.14 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  27.5 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  29.13 
 
 		 559 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  26.96 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  27.7 
 
 		 554 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  27.68 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  27.12 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  28.39 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  29.37 
 
 		 576 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  28.27 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.23 
 
 		 584 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  28.65 
 
 		 571 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  29.58 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.2 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  28.05 
 
 		 577 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  29.58 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  28.83 
 
 		 584 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  28.33 
 
 		 516 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  28.33 
 
 		 516 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  28.33 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  28.91 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  28.39 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  28.33 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  28.32 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  28.19 
 
 		 592 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  28.32 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  28.33 
 
 		 551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  27.91 
 
 		 516 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  27.88 
 
 		 562 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  27.89 
 
 		 552 aa  157  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.47 
 
 		 577 aa  156  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  28.14 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  27.82 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  28.14 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  28.14 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  27.82 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  27.95 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  27.72 
 
 		 554 aa  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  28.94 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  28.4 
 
 		 572 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  24.8 
 
 		 665 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.57 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.8 
 
 		 570 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  27.35 
 
 		 553 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  27.72 
 
 		 553 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  26.8 
 
 		 561 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  28.17 
 
 		 544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  27.82 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>