More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6322 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 499 aa  945    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  78.01 
 
 		 492 aa  679    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  62.18 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  59.63 
 
 		 546 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  58.94 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  59.63 
 
 		 546 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  57.76 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  53.72 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  77.82 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  68.94 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.29 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  63.6 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  54.39 
 
 		 603 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  65.43 
 
 		 580 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  56.2 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  65.34 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  65.34 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  65.34 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  55.31 
 
 		 580 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  48.41 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  49.48 
 
 		 562 aa  226  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  49.12 
 
 		 551 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  54.96 
 
 		 614 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  40.86 
 
 		 693 aa  207  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  51.05 
 
 		 579 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.2 
 
 		 530 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.72 
 
 		 516 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  32.12 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  31.89 
 
 		 584 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.75 
 
 		 659 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  34.26 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  32.12 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.11 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  33.72 
 
 		 516 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  33.49 
 
 		 516 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  33.72 
 
 		 516 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  33.72 
 
 		 516 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  33.72 
 
 		 516 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  33.72 
 
 		 516 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  33.49 
 
 		 516 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  33.49 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  33.49 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.86 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  30.68 
 
 		 661 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  31.13 
 
 		 665 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  32.93 
 
 		 541 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.93 
 
 		 541 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  32.66 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  31.89 
 
 		 584 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  31.36 
 
 		 511 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  31.8 
 
 		 513 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  30.6 
 
 		 553 aa  176  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  32.85 
 
 		 515 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  33.26 
 
 		 519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  33.46 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  32.68 
 
 		 559 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  30.84 
 
 		 577 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  32.28 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  30.77 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.62 
 
 		 554 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.77 
 
 		 515 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  30.95 
 
 		 659 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  30.74 
 
 		 657 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  30.96 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  31.91 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  33.33 
 
 		 568 aa  163  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  31.23 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  31.23 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  32.29 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  31.23 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  31.23 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  31.23 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  32.29 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  32.13 
 
 		 561 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  31.33 
 
 		 664 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  31.23 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  33.05 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  30.99 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  30.99 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  31.36 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  30.99 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  33.4 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  29.62 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  32.58 
 
 		 551 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  30.08 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  30.86 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  29.74 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  30.34 
 
 		 559 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  32.86 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  30.47 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  30.47 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  30.47 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  30.72 
 
 		 564 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  29.48 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  30.31 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  29.77 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.62 
 
 		 560 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  30.31 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  29.55 
 
 		 550 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  29.72 
 
 		 554 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>