More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4131 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  100 
 
 		 551 aa  1062    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  56.73 
 
 		 591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  56.13 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  47.22 
 
 		 580 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  49.64 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  47.53 
 
 		 573 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  47.22 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  48.19 
 
 		 580 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  47.91 
 
 		 580 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  47.91 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  47.91 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  47.91 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  50.27 
 
 		 546 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  44.6 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  45.41 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  43.86 
 
 		 614 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  39.78 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  49.12 
 
 		 499 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  49.09 
 
 		 492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  48.06 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  46.56 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  35.01 
 
 		 693 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  45.86 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  52.36 
 
 		 495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  29.33 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  29.71 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  28.63 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  28.91 
 
 		 574 aa  174  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  27.83 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  27.8 
 
 		 584 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  27.83 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  28.81 
 
 		 554 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  28.81 
 
 		 554 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  29.3 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  28.63 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  28.38 
 
 		 550 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  28.17 
 
 		 548 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.81 
 
 		 560 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  28.83 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  28.93 
 
 		 515 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  28.18 
 
 		 549 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  28.05 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  28.05 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  28.18 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  28.18 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  28.18 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  28.18 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  26.68 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  28.18 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  28.05 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.77 
 
 		 659 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  28 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  28.18 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  28.43 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  27.2 
 
 		 584 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  28 
 
 		 549 aa  165  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  28.34 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  28.34 
 
 		 549 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  29.63 
 
 		 561 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  26.55 
 
 		 577 aa  163  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  28.34 
 
 		 549 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.63 
 
 		 561 aa  164  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  28.34 
 
 		 549 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  28.34 
 
 		 549 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  28.47 
 
 		 563 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  27.66 
 
 		 552 aa  163  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  27.66 
 
 		 552 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  27.27 
 
 		 552 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  28.52 
 
 		 574 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  30.29 
 
 		 564 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  26.19 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  29.97 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  29.97 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  30.02 
 
 		 590 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  26.17 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  28.81 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  28.81 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.67 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.36 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.17 
 
 		 575 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  28.36 
 
 		 571 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  27.97 
 
 		 549 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  28.74 
 
 		 576 aa  157  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  28.89 
 
 		 659 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  28.23 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  27.22 
 
 		 577 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  26.87 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  26.11 
 
 		 637 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  28.87 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  28.48 
 
 		 657 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  26.68 
 
 		 572 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  28.15 
 
 		 552 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  28.62 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  28.54 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  29.96 
 
 		 561 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  29.33 
 
 		 516 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  29.96 
 
 		 561 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  26.9 
 
 		 665 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  27.55 
 
 		 561 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>