More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4125 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  78.32 
 
 		 482 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  76.94 
 
 		 483 aa  749    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  76.68 
 
 		 482 aa  745    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  100 
 
 		 479 aa  952    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  55.01 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  54.95 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  54.58 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  53.67 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  54.29 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  55.22 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  54.86 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  48.95 
 
 		 492 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  49.28 
 
 		 515 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  51.39 
 
 		 475 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  44.95 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  40.65 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  41.78 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  38.88 
 
 		 449 aa  279  7e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  31.63 
 
 		 460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.77 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.64 
 
 		 460 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  29.52 
 
 		 459 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  29.52 
 
 		 459 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  29.48 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.04 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  29.06 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  28.05 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  28.28 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.66 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.3 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.84 
 
 		 461 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.12 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  29.23 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.27 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  28.73 
 
 		 505 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  28.73 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  28.73 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  30.11 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.23 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  23.1 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.38 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  30.77 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.48 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 638 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.04 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.93 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.25 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.89 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.7 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.26 
 
 		 508 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.94 
 
 		 557 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 505 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.28 
 
 		 565 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.66 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.75 
 
 		 557 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.34 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.7 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.87 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.75 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.71 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.75 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  26.28 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  26.92 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.93 
 
 		 487 aa  94.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.8 
 
 		 518 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.03 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.87 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  28.19 
 
 		 639 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.62 
 
 		 551 aa  93.2  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.84 
 
 		 530 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.22 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.22 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  25.65 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.65 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.29 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  23.1 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 476 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.11 
 
 		 506 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 492 aa  90.9  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  23.83 
 
 		 520 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>