More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5457 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  78.79 
 
 		 479 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  89.24 
 
 		 483 aa  849    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  88.79 
 
 		 482 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  100 
 
 		 482 aa  967    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  55.58 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  55.06 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  54.39 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  54.95 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  53.28 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  53.39 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  50.11 
 
 		 492 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  53.35 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  48.9 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  50 
 
 		 475 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  44.42 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  40.04 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  41.59 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  38.5 
 
 		 449 aa  289  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  31.69 
 
 		 460 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.24 
 
 		 483 aa  156  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 476 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.21 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.9 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  27.88 
 
 		 507 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.27 
 
 		 474 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.14 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.39 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  30.04 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.85 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.61 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.69 
 
 		 479 aa  120  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  30.47 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.98 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  30.98 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.64 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 505 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 505 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.38 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  28.77 
 
 		 505 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.39 
 
 		 493 aa  106  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.49 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 508 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.21 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.21 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.02 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.69 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  26.14 
 
 		 529 aa  100  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.77 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.43 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.2 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  27.83 
 
 		 476 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.09 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.2 
 
 		 557 aa  97.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  26.56 
 
 		 496 aa  97.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.21 
 
 		 489 aa  96.7  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  24.87 
 
 		 468 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.07 
 
 		 497 aa  96.7  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.11 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.64 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.61 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  23.72 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.71 
 
 		 529 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.24 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.61 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 492 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.98 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.17 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.22 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.21 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.23 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.65 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.92 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.79 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.65 
 
 		 557 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  25.55 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.15 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.28 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.24 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.99 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>