More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2738 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  100 
 
 		 523 aa  1006    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.02 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  41.27 
 
 		 516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  42.25 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  40.69 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  41.47 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  40.69 
 
 		 516 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  40.69 
 
 		 516 aa  359  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  40.88 
 
 		 516 aa  359  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  40.69 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  40.69 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  40.69 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  42.35 
 
 		 511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  40.5 
 
 		 516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.12 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  41.41 
 
 		 548 aa  353  5e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.66 
 
 		 516 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  41.8 
 
 		 519 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.07 
 
 		 534 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  40.75 
 
 		 559 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  40.43 
 
 		 553 aa  345  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.57 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  39.45 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  40.04 
 
 		 568 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.21 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.56 
 
 		 659 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  39.27 
 
 		 552 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  38.92 
 
 		 552 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  38.8 
 
 		 552 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  39.29 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  38.37 
 
 		 552 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  39.63 
 
 		 577 aa  333  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.31 
 
 		 561 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  41.31 
 
 		 561 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  38.74 
 
 		 554 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  38.42 
 
 		 551 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  40.93 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  38.55 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  38.55 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  38.91 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  38.95 
 
 		 552 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  38.36 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  38.04 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  38.91 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  38.72 
 
 		 551 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  41.01 
 
 		 528 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  40.8 
 
 		 563 aa  330  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  41.15 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.46 
 
 		 563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  38.13 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  41.5 
 
 		 540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.44 
 
 		 557 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.44 
 
 		 557 aa  325  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  39.17 
 
 		 513 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  39.31 
 
 		 552 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  40.95 
 
 		 563 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  40.95 
 
 		 563 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  38.5 
 
 		 561 aa  323  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  42.46 
 
 		 538 aa  323  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  36.71 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  40.51 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  36.43 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  40.11 
 
 		 537 aa  321  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.51 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  40.73 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.19 
 
 		 508 aa  320  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  41.44 
 
 		 552 aa  319  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.84 
 
 		 575 aa  319  9e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  35.24 
 
 		 665 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.45 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  40.93 
 
 		 561 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  39.57 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  37.87 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.99 
 
 		 508 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  39.57 
 
 		 520 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  39.69 
 
 		 520 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.91 
 
 		 563 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.82 
 
 		 538 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  39.18 
 
 		 520 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  37.82 
 
 		 576 aa  316  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  37.82 
 
 		 576 aa  316  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  34.91 
 
 		 661 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  36.7 
 
 		 549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  39.78 
 
 		 562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  38.22 
 
 		 541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  37.09 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.05 
 
 		 577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  38.03 
 
 		 541 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.25 
 
 		 541 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  36.89 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  36.89 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  39.07 
 
 		 528 aa  313  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  36.89 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  36.7 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>