18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60304 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60304  urea transport protein  100 
 
 
520 aa  1033    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.087993 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50012  predicted protein  29.63 
 
 
578 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0346836  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24399  SSS family transporter: sodium ion/solute  26.26 
 
 
577 aa  113  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  25.54 
 
 
507 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  23.36 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  36.04 
 
 
680 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  27.5 
 
 
693 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.51 
 
 
554 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  22.62 
 
 
489 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  25.19 
 
 
724 aa  47  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  28.26 
 
 
487 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 
692 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  28.99 
 
 
482 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  31.93 
 
 
488 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  32.95 
 
 
498 aa  44.3  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.88 
 
 
518 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  24.71 
 
 
674 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  25.29 
 
 
182 aa  43.5  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>