18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50012 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50012  predicted protein  100 
 
 		 578 aa  1176    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0346836  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24399  SSS family transporter: sodium ion/solute  41.49 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  31.22 
 
 		 507 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  31.39 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60304  urea transport protein  29.15 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.087993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  25.55 
 
 		 639 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.78 
 
 		 638 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 482 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  26.84 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  27.61 
 
 		 1323 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.81 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 1323 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.34 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  25.91 
 
 		 557 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.61 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 483 aa  43.9  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 692 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>