More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2263 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  100 
 
 		 474 aa  929    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  86.97 
 
 		 476 aa  747    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  49.25 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  48.82 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  49.16 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  28.41 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  24.3 
 
 		 709 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  28.19 
 
 		 554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  28.43 
 
 		 556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  23.5 
 
 		 680 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  23.97 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  27.84 
 
 		 724 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  25.17 
 
 		 674 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  23.47 
 
 		 699 aa  113  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 692 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.54 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  26.96 
 
 		 693 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  23.41 
 
 		 643 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  24.2 
 
 		 658 aa  110  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.12 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.7 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.23 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.23 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  24.57 
 
 		 659 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.92 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.96 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.58 
 
 		 485 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.57 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.23 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.28 
 
 		 483 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.28 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.28 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.28 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  26.42 
 
 		 497 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.17 
 
 		 488 aa  97.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  26.47 
 
 		 497 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  24.83 
 
 		 507 aa  96.7  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 482 aa  96.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.12 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26.6 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.51 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.06 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.88 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  24.56 
 
 		 498 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  26 
 
 		 512 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  26 
 
 		 512 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.64 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  22.24 
 
 		 668 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  26.13 
 
 		 553 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  23.45 
 
 		 511 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.48 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.36 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.12 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.12 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.12 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.12 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.12 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.12 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  26.59 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  28.37 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.73 
 
 		 486 aa  87  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3847  sodium/proline symporter  24.26 
 
 		 498 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  25.23 
 
 		 498 aa  86.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  25 
 
 		 479 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.17 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.36 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  24.23 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.08 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.71 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.07 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.16 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.81 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  25.21 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.05 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  21.66 
 
 		 668 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3013  sodium/proline symporter  24.41 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.58 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.23 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.47 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>