58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20424 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  90.88 
 
 		 643 aa  1166    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  100 
 
 		 704 aa  1412    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  57.77 
 
 		 709 aa  722    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  39.83 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  38.33 
 
 		 674 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  39.64 
 
 		 699 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  36.88 
 
 		 724 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  33.38 
 
 		 680 aa  360  6e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  31.6 
 
 		 659 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  33.03 
 
 		 658 aa  314  4.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  30.41 
 
 		 668 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  29.09 
 
 		 668 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  29.97 
 
 		 679 aa  278  4e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 692 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  25.64 
 
 		 478 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 482 aa  124  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  23.71 
 
 		 476 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.94 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  23.14 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  22.93 
 
 		 500 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  24.66 
 
 		 587 aa  92  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  25.26 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  21.83 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.82 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.43 
 
 		 474 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  22.95 
 
 		 544 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 638 aa  54.3  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  24.12 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  24.54 
 
 		 541 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  32.2 
 
 		 527 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.87 
 
 		 483 aa  51.6  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.92 
 
 		 541 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.03 
 
 		 487 aa  50.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  28.18 
 
 		 500 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  23.88 
 
 		 498 aa  49.7  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.65 
 
 		 476 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 510 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.58 
 
 		 486 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 479 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  29.79 
 
 		 459 aa  48.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  20.85 
 
 		 461 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  21.44 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.19 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  24.21 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.17 
 
 		 459 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.87 
 
 		 461 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  29.41 
 
 		 497 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.83 
 
 		 492 aa  45.8  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.06 
 
 		 552 aa  45.8  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  22.4 
 
 		 639 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.27 
 
 		 565 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  21.63 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 472 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  26.18 
 
 		 482 aa  44.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  24.65 
 
 		 554 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.62 
 
 		 613 aa  44.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 527 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>