More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3985 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 527 aa  1063    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  71.1 
 
 		 527 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  72.47 
 
 		 529 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  33.55 
 
 		 522 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.5 
 
 		 892 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  33.26 
 
 		 883 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  31.99 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  31.99 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  31.99 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  31.99 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.43 
 
 		 542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.33 
 
 		 510 aa  193  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.33 
 
 		 510 aa  193  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.42 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.21 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  30.13 
 
 		 570 aa  189  8e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  28.12 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.93 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  26.46 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.26 
 
 		 574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.8 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.59 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  25.67 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  30.92 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  28.21 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  25 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  24.76 
 
 		 581 aa  144  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.03 
 
 		 523 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  24.62 
 
 		 562 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.79 
 
 		 556 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  26.6 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.96 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  26.9 
 
 		 468 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.6 
 
 		 592 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  25 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  26.74 
 
 		 533 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.44 
 
 		 479 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  25.56 
 
 		 523 aa  120  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  25.14 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.64 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.34 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  24.47 
 
 		 568 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  25 
 
 		 468 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  26.89 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.26 
 
 		 548 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.77 
 
 		 545 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.12 
 
 		 533 aa  109  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.84 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.58 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.52 
 
 		 522 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  23.52 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.81 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.81 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.6 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.94 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.72 
 
 		 520 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  25.94 
 
 		 565 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.05 
 
 		 539 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.25 
 
 		 561 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24.01 
 
 		 562 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.99 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  24.08 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  22.89 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.03 
 
 		 598 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.75 
 
 		 561 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.54 
 
 		 522 aa  97.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  25.06 
 
 		 583 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.51 
 
 		 551 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  23.53 
 
 		 583 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  27.29 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  27.65 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.13 
 
 		 613 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 509 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.36 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  22.73 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.98 
 
 		 537 aa  90.5  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  24.72 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  23.74 
 
 		 570 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.82 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  23.81 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  23.65 
 
 		 564 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  21.4 
 
 		 577 aa  87.4  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  24.09 
 
 		 561 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.51 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 		 557 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.07 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  25.74 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  23.19 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  24.17 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.51 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>