More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1671 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 593 aa  1194    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  52.31 
 
 		 537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.24 
 
 		 550 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.09 
 
 		 567 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  44.71 
 
 		 565 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.26 
 
 		 613 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  43.4 
 
 		 569 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  45.78 
 
 		 562 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  44.34 
 
 		 564 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  43.1 
 
 		 560 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  44.7 
 
 		 566 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  29.13 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.48 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.72 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  28.26 
 
 		 545 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  30.48 
 
 		 549 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.69 
 
 		 565 aa  187  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  29.79 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  29.18 
 
 		 561 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  27.29 
 
 		 551 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  26.26 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.88 
 
 		 522 aa  176  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  27.89 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.79 
 
 		 561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.55 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.29 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.25 
 
 		 522 aa  170  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.74 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  28.95 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.31 
 
 		 523 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.02 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  28.94 
 
 		 568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.74 
 
 		 520 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  28.5 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.37 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.02 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.79 
 
 		 548 aa  155  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.97 
 
 		 530 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  27.87 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.61 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.87 
 
 		 526 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.96 
 
 		 526 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  28.76 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.39 
 
 		 523 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.51 
 
 		 598 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.19 
 
 		 533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.56 
 
 		 542 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  25.61 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  25.53 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.38 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.48 
 
 		 474 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  24.34 
 
 		 571 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  24.12 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  24.12 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  24.12 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  24.12 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.38 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  24.12 
 
 		 571 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  25.1 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  27.01 
 
 		 551 aa  113  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  25.82 
 
 		 596 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  23.83 
 
 		 530 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  22.79 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.25 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  23.96 
 
 		 537 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.15 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  21.32 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.42 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  22.13 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.98 
 
 		 504 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.21 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.21 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.21 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  24.83 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  23.25 
 
 		 596 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 474 aa  98.2  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  21.41 
 
 		 883 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.16 
 
 		 492 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.68 
 
 		 489 aa  97.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  25.33 
 
 		 562 aa  97.1  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.19 
 
 		 574 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  22.46 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 609 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.48 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.77 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.48 
 
 		 892 aa  94.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  24.57 
 
 		 489 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.31 
 
 		 486 aa  93.6  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.57 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  22.61 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  23.74 
 
 		 492 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  23.81 
 
 		 531 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  23.74 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.97 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 603 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 472 aa  90.5  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.59 
 
 		 527 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>