More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0610 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  100 
 
 		 551 aa  1096    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  44.16 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  44.16 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  44.16 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  44.16 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  44.34 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  43.98 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  44.36 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  44.73 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  45.49 
 
 		 562 aa  418  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  37.96 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  39.96 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.38 
 
 		 473 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.14 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.5 
 
 		 474 aa  263  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  34.16 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  34.16 
 
 		 520 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  31.21 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  32.48 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.41 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  32.23 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  33.69 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.33 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.16 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  30.31 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.02 
 
 		 520 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  32.97 
 
 		 592 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  32.74 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  33.02 
 
 		 520 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.44 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.72 
 
 		 522 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.36 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.68 
 
 		 519 aa  208  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  28.97 
 
 		 545 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.41 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.21 
 
 		 486 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  30.69 
 
 		 565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.66 
 
 		 548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  32.97 
 
 		 561 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  30.47 
 
 		 523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  43.14 
 
 		 234 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  29.51 
 
 		 551 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.79 
 
 		 533 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  30.53 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  32.25 
 
 		 765 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  28.11 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.52 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.02 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  25.45 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.34 
 
 		 596 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.47 
 
 		 567 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.41 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  26.36 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.62 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.04 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.28 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.22 
 
 		 562 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.97 
 
 		 513 aa  97.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  24.66 
 
 		 566 aa  96.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.47 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.87 
 
 		 488 aa  94  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.41 
 
 		 550 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.46 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.73 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.73 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.73 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.73 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.73 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.73 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.73 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.58 
 
 		 492 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.97 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.81 
 
 		 613 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.7 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.7 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.04 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  22.68 
 
 		 520 aa  87  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.96 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.71 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  22.98 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.11 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  24.43 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.75 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.05 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.96 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  25.36 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.89 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.45 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.2 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.17 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.25 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.25 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.3 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.17 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.17 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>