More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2325 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  100 
 
 		 489 aa  969    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.08 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.45 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.3 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.13 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.59 
 
 		 520 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.63 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.11 
 
 		 548 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  24.73 
 
 		 459 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 515 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 482 aa  93.2  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.13 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  25.28 
 
 		 562 aa  91.3  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.18 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  27.81 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.63 
 
 		 545 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  25.43 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  24.43 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  25.47 
 
 		 571 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  24.77 
 
 		 571 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  24.77 
 
 		 571 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.26 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  24.77 
 
 		 571 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  24.77 
 
 		 571 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25.62 
 
 		 592 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  25.23 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.24 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.41 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.54 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.81 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.56 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.48 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  24.4 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.8 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.61 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  24.87 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  25.99 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.72 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.05 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.27 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.8 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  26.02 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.32 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  21.25 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  25.57 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.25 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.09 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.67 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  22.78 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.41 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  22.54 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  23.3 
 
 		 568 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.96 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  22.11 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  22.11 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  22.11 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  22.11 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.86 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  25.63 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.69 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  22.11 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  22.11 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  21.85 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  21.85 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  20.59 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  21.85 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.59 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.4 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.64 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.53 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.16 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  20.66 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  25.2 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  26.08 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.23 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  22.67 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.02 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.76 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  22.42 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  22.42 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  22.42 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  22.68 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>