More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00234 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.12 
 
 		 520 aa  687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  100 
 
 		 520 aa  1040    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  62.14 
 
 		 522 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  72.69 
 
 		 520 aa  769    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  70.25 
 
 		 523 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  67.31 
 
 		 520 aa  687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.96 
 
 		 522 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.77 
 
 		 520 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.7 
 
 		 522 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.18 
 
 		 519 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  61.2 
 
 		 592 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.99 
 
 		 548 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  47.87 
 
 		 562 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  47.14 
 
 		 561 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  48.16 
 
 		 549 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  45.92 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.43 
 
 		 522 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  46.06 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  46.08 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  47.57 
 
 		 536 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  41.34 
 
 		 565 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.63 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  43.75 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  41.67 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  35.46 
 
 		 523 aa  306  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.52 
 
 		 533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.33 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  34.46 
 
 		 531 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  32.45 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  32.45 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  32.45 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  32.26 
 
 		 571 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  32.45 
 
 		 571 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  32.26 
 
 		 571 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  34.67 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.74 
 
 		 565 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  32.61 
 
 		 598 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  33.71 
 
 		 551 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  32.48 
 
 		 551 aa  226  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  30.18 
 
 		 551 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  32.9 
 
 		 557 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  32.89 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.11 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.01 
 
 		 473 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  39.32 
 
 		 765 aa  206  8e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.19 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.9 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.13 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  29.83 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  28.79 
 
 		 530 aa  194  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  28.37 
 
 		 532 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  29.26 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.05 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.84 
 
 		 613 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.31 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.56 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  28.26 
 
 		 562 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.06 
 
 		 564 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.92 
 
 		 567 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  27.74 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  28.05 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.63 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  28.04 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 486 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.77 
 
 		 542 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 526 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.39 
 
 		 505 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.19 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  28.97 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.06 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.3 
 
 		 581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  24.95 
 
 		 575 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.32 
 
 		 883 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.71 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.43 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.25 
 
 		 892 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 		 509 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  27.78 
 
 		 581 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.11 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  29.15 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  27.88 
 
 		 481 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  28.47 
 
 		 566 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.4 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.36 
 
 		 474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.82 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 556 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.66 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.74 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 489 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  24.37 
 
 		 527 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.88 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  23.81 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  26.2 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  23.54 
 
 		 570 aa  104  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  25.23 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.17 
 
 		 461 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 603 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.01 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.65 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>