More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0436 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 598 aa  1167    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  41.2 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  35.12 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  35.53 
 
 		 592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  33.53 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.41 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  34.15 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  34.86 
 
 		 557 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.73 
 
 		 519 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.71 
 
 		 520 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  30.2 
 
 		 545 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  33 
 
 		 520 aa  229  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  33.93 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.31 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  34.87 
 
 		 557 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.85 
 
 		 548 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  35.47 
 
 		 551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.07 
 
 		 522 aa  220  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.72 
 
 		 522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.03 
 
 		 522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30 
 
 		 565 aa  210  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  30.26 
 
 		 539 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  29.68 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.33 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  28.88 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.93 
 
 		 522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  34.35 
 
 		 536 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  30.4 
 
 		 549 aa  199  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  31.53 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  29.48 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.48 
 
 		 526 aa  188  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  28.27 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.01 
 
 		 561 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  26.89 
 
 		 561 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  30.49 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.79 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.85 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.81 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  28.76 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.09 
 
 		 473 aa  160  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  27.16 
 
 		 571 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  26.96 
 
 		 571 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.82 
 
 		 526 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  26.96 
 
 		 571 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  26.96 
 
 		 571 aa  156  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  26.96 
 
 		 571 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  26.96 
 
 		 571 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  29.58 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  27.63 
 
 		 529 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  25.45 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  26.28 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.54 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  28.42 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.14 
 
 		 593 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.85 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.62 
 
 		 613 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  26.6 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  27.68 
 
 		 765 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  27.21 
 
 		 569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.64 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  27.4 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  28.22 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 		 567 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  29.06 
 
 		 883 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  27.33 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  28.28 
 
 		 564 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.65 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.71 
 
 		 509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  25.33 
 
 		 532 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.65 
 
 		 520 aa  120  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.5 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.09 
 
 		 892 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.82 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.77 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.86 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.29 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.29 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.82 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.29 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.29 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.88 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.57 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.57 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  31.6 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 472 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.67 
 
 		 527 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.05 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  26.69 
 
 		 533 aa  100  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.02 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.4 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  26.75 
 
 		 604 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  28.67 
 
 		 491 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.77 
 
 		 526 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>