More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0335 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  72.19 
 
 		 523 aa  752    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 526 aa  1050    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  41.87 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.97 
 
 		 542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  32.13 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  29.68 
 
 		 520 aa  176  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  27.06 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  30.21 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  31.59 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  29.2 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.22 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  30.47 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  29.76 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.24 
 
 		 479 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  29.33 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  35.69 
 
 		 562 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  33.13 
 
 		 566 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.84 
 
 		 513 aa  156  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 		 892 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  28.88 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  30.11 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  32.55 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  33.22 
 
 		 565 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  28.77 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  33.75 
 
 		 581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.67 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  28.69 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.92 
 
 		 883 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.82 
 
 		 574 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  31.77 
 
 		 547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  28.9 
 
 		 473 aa  140  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.64 
 
 		 551 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.18 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.68 
 
 		 509 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  26.44 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.71 
 
 		 526 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.18 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.81 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.51 
 
 		 565 aa  123  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  25.69 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.75 
 
 		 548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.53 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.29 
 
 		 505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  29.5 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  31.94 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 526 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 		 564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.76 
 
 		 527 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.9 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.69 
 
 		 562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.9 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  24.02 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  24.21 
 
 		 501 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  22.45 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  22.26 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  22.26 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  22.26 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  22.26 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  22.45 
 
 		 571 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  28.33 
 
 		 517 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  26.14 
 
 		 493 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25 
 
 		 592 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.25 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.15 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.47 
 
 		 613 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.96 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.9 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.99 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  23.47 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  24.1 
 
 		 530 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.12 
 
 		 523 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.75 
 
 		 569 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  23.4 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.04 
 
 		 483 aa  103  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  23.19 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.66 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  25.65 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.97 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.77 
 
 		 598 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.65 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.38 
 
 		 474 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  22.4 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.11 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.01 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.92 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.84 
 
 		 561 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.17 
 
 		 520 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  21.64 
 
 		 529 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.71 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.79 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  22.69 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  25.54 
 
 		 570 aa  95.1  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  21.68 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>