More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2732 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  82.71 
 
 		 561 aa  933    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 561 aa  1117    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  68.62 
 
 		 565 aa  790    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  56.97 
 
 		 568 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  56.92 
 
 		 562 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  53.98 
 
 		 539 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  53.55 
 
 		 561 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  52.29 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  49.91 
 
 		 545 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.64 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  50.62 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.33 
 
 		 523 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  43.75 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.09 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  43.32 
 
 		 520 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  44.32 
 
 		 520 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.86 
 
 		 519 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.32 
 
 		 520 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.05 
 
 		 522 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.58 
 
 		 548 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.31 
 
 		 522 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  44.11 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.89 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  40.78 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  33.13 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.4 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  33.76 
 
 		 551 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.65 
 
 		 533 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  32.85 
 
 		 551 aa  202  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  33.33 
 
 		 557 aa  193  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.17 
 
 		 526 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.71 
 
 		 557 aa  190  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  30.21 
 
 		 551 aa  183  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.87 
 
 		 526 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  31.93 
 
 		 531 aa  180  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  31.67 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 		 598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 537 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.51 
 
 		 596 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.77 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  29 
 
 		 530 aa  167  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  35.33 
 
 		 765 aa  166  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  28.63 
 
 		 529 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  27.13 
 
 		 571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.81 
 
 		 593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  26.76 
 
 		 571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  26.76 
 
 		 571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  26.76 
 
 		 571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  27.03 
 
 		 571 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  26.74 
 
 		 571 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  31.13 
 
 		 562 aa  163  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  27.78 
 
 		 532 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.18 
 
 		 474 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.57 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  27.77 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  26.35 
 
 		 569 aa  153  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 		 564 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.8 
 
 		 567 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  28.69 
 
 		 562 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  27.21 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  28.27 
 
 		 560 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.15 
 
 		 550 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.96 
 
 		 505 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.49 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.74 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  23.62 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.79 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  22.32 
 
 		 581 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25.52 
 
 		 575 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.63 
 
 		 520 aa  99.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.9 
 
 		 522 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.81 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  26.79 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.76 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.76 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  23.51 
 
 		 604 aa  91.3  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  25.94 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.95 
 
 		 517 aa  90.1  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  24.88 
 
 		 523 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.9 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.78 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  24.35 
 
 		 599 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.71 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.21 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  23.58 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.03 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  23.43 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.01 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  22.78 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.08 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  24.19 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.43 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  25.31 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.41 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>