More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4112 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  69.43 
 
 		 529 aa  706    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 526 aa  1040    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  31.24 
 
 		 551 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.16 
 
 		 551 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.97 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.38 
 
 		 526 aa  236  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.13 
 
 		 565 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.37 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  32.25 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.02 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  31.55 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  30.79 
 
 		 520 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.22 
 
 		 520 aa  203  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  29.53 
 
 		 523 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  28.73 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.36 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  27.98 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.8 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.37 
 
 		 522 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  27.5 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.68 
 
 		 522 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  29.13 
 
 		 520 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.44 
 
 		 548 aa  193  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.16 
 
 		 592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.32 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  30.32 
 
 		 568 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.64 
 
 		 522 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  28.85 
 
 		 561 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  28.26 
 
 		 539 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  30.18 
 
 		 529 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  26.69 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.55 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.27 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  26.97 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.59 
 
 		 598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  26.38 
 
 		 596 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  26.42 
 
 		 571 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  26.42 
 
 		 571 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  26.42 
 
 		 571 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  26.42 
 
 		 571 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  26.18 
 
 		 571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  25.94 
 
 		 571 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  26.45 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.4 
 
 		 593 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.98 
 
 		 613 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25.64 
 
 		 565 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.65 
 
 		 567 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  26.43 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.99 
 
 		 569 aa  124  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.59 
 
 		 564 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  26.06 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  27.41 
 
 		 551 aa  118  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.55 
 
 		 562 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.6 
 
 		 474 aa  114  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  23.99 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.89 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 526 aa  107  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  26.25 
 
 		 566 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.83 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  22.92 
 
 		 523 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 597 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.23 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.18 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 765 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.78 
 
 		 560 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 575 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.41 
 
 		 575 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 603 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  21.94 
 
 		 486 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  25.79 
 
 		 501 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  24.32 
 
 		 570 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.43 
 
 		 542 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  22.91 
 
 		 587 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  22.88 
 
 		 513 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 		 509 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.58 
 
 		 584 aa  87  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  25 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.21 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  23.63 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  22.66 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  23.92 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  22.92 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  23.6 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  22.24 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  23.74 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  21.66 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.83 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  22.01 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.9 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  22.51 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  26.35 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.75 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>