More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6118 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  72.06 
 
 		 560 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  65.61 
 
 		 569 aa  707    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  64.78 
 
 		 565 aa  693    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  73.67 
 
 		 566 aa  751    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 562 aa  1095    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  63.99 
 
 		 564 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.07 
 
 		 613 aa  700    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  49.55 
 
 		 537 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.94 
 
 		 550 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.96 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.58 
 
 		 567 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.45 
 
 		 551 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  30.91 
 
 		 557 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.3 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  30.59 
 
 		 557 aa  193  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  30.37 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  28.73 
 
 		 520 aa  177  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.75 
 
 		 565 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  29.39 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.29 
 
 		 542 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.51 
 
 		 526 aa  171  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.15 
 
 		 522 aa  170  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  28.7 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.38 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.7 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27 
 
 		 592 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  29.21 
 
 		 562 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.74 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.94 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  29.12 
 
 		 598 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  28.09 
 
 		 565 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  29.68 
 
 		 568 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.43 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  27.5 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.66 
 
 		 509 aa  156  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.93 
 
 		 561 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.13 
 
 		 520 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  28.07 
 
 		 520 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.07 
 
 		 520 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.57 
 
 		 522 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.94 
 
 		 561 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.84 
 
 		 520 aa  151  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.13 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.6 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.87 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.02 
 
 		 474 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  28.91 
 
 		 561 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.06 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  28.15 
 
 		 529 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.5 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.47 
 
 		 581 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  27.85 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.21 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  27.05 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.24 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.17 
 
 		 556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.95 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  26.22 
 
 		 571 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  26.22 
 
 		 571 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  26.22 
 
 		 571 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  26.22 
 
 		 571 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.05 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  26.22 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.22 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 517 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  22.42 
 
 		 597 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  25.23 
 
 		 596 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  25.81 
 
 		 571 aa  110  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.95 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.3 
 
 		 476 aa  107  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.03 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  24.43 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.5 
 
 		 596 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.3 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.87 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.33 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  24.67 
 
 		 883 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  25.18 
 
 		 468 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  26.94 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 596 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  25.1 
 
 		 562 aa  96.7  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.2 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  23.29 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  24.44 
 
 		 501 aa  94.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.27 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  23.89 
 
 		 603 aa  94  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  26.44 
 
 		 486 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  25.28 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25 
 
 		 575 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23.52 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.34 
 
 		 461 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.51 
 
 		 566 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 489 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.3 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  23.67 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  23.41 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.52 
 
 		 498 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>