More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1112 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  67.74 
 
 		 565 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 561 aa  1116    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  82.71 
 
 		 561 aa  896    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  53.7 
 
 		 568 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  54.53 
 
 		 562 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  52.28 
 
 		 561 aa  532  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  52.55 
 
 		 539 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  49.74 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  50.09 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.19 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  50.8 
 
 		 536 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.55 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.92 
 
 		 522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  42.63 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.76 
 
 		 548 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.37 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  41.71 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.63 
 
 		 522 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.37 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  46.95 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  41.71 
 
 		 592 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.71 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.34 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  41.7 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  32.39 
 
 		 523 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  32.26 
 
 		 551 aa  220  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.62 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.82 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.13 
 
 		 526 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  32.44 
 
 		 551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  33.11 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.32 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  31.26 
 
 		 529 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  31.04 
 
 		 557 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  31.46 
 
 		 557 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  30.54 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  28.32 
 
 		 571 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  28.32 
 
 		 571 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  28.36 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  28.32 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  28.32 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  28.32 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  28.13 
 
 		 571 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  29.72 
 
 		 529 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.73 
 
 		 613 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.45 
 
 		 473 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.55 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.58 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  29.35 
 
 		 596 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.81 
 
 		 598 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  35.13 
 
 		 765 aa  170  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.44 
 
 		 474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  29.63 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  26.45 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  30.94 
 
 		 562 aa  160  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.25 
 
 		 567 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  28.12 
 
 		 565 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.16 
 
 		 562 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.16 
 
 		 550 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.08 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.71 
 
 		 566 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.68 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  26.6 
 
 		 560 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.23 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.01 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.95 
 
 		 509 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.75 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 542 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.22 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.89 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.23 
 
 		 526 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 472 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  26.18 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  22.37 
 
 		 581 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  26.14 
 
 		 547 aa  94.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  23.95 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 604 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  22.96 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.98 
 
 		 526 aa  87.8  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  22.49 
 
 		 562 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.72 
 
 		 517 aa  87  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  23.61 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  24.18 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.71 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.35 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  23.38 
 
 		 568 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.36 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  24.53 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  22.63 
 
 		 603 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  25 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.02 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.09 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  23.2 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  22.93 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>