More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4187 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  99.65 
 
 
571 aa  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  99.65 
 
 
571 aa  1142    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  98.77 
 
 
571 aa  1135    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  99.12 
 
 
571 aa  1141    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  99.65 
 
 
571 aa  1142    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  100 
 
 
571 aa  1144    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  47.49 
 
 
562 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  50.38 
 
 
529 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  45.42 
 
 
531 aa  435  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  44.16 
 
 
551 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  40.08 
 
 
532 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  39.69 
 
 
530 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.83 
 
 
473 aa  286  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.76 
 
 
474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.77 
 
 
474 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  35.48 
 
 
509 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  31.06 
 
 
520 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  32.26 
 
 
520 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.37 
 
 
486 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.26 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  30.69 
 
 
592 aa  213  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.09 
 
 
565 aa  210  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.45 
 
 
522 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.77 
 
 
522 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  30.48 
 
 
539 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  31.42 
 
 
545 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  31.82 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  45.02 
 
 
234 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  30.32 
 
 
562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.69 
 
 
519 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  31.4 
 
 
557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.31 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  29.78 
 
 
551 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.72 
 
 
522 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.86 
 
 
526 aa  194  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  33.19 
 
 
486 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  31.29 
 
 
568 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  30.36 
 
 
520 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.12 
 
 
520 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  30.23 
 
 
549 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.82 
 
 
522 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.18 
 
 
548 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.08 
 
 
520 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  27.98 
 
 
551 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  30.14 
 
 
561 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.32 
 
 
561 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  31.51 
 
 
523 aa  173  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  30.8 
 
 
565 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  34.81 
 
 
765 aa  159  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  32.78 
 
 
536 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  30.66 
 
 
596 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  29.36 
 
 
561 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.76 
 
 
598 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.42 
 
 
526 aa  143  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  26.4 
 
 
529 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.26 
 
 
567 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.6 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.45 
 
 
569 aa  115  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.79 
 
 
564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.29 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  24.36 
 
 
523 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.99 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.73 
 
 
565 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.87 
 
 
566 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.27 
 
 
562 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.45 
 
 
560 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.94 
 
 
526 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.88 
 
 
474 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.26 
 
 
510 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.26 
 
 
510 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.34 
 
 
550 aa  94  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  20.77 
 
 
581 aa  93.6  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.95 
 
 
513 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.21 
 
 
526 aa  91.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 
542 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.79 
 
 
509 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.48 
 
 
505 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.45 
 
 
486 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.62 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  23.53 
 
 
460 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.67 
 
 
513 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.34 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.17 
 
 
574 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  22.54 
 
 
489 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  24.77 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  26.13 
 
 
581 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  28.83 
 
 
496 aa  80.1  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  25.25 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  24.48 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.83 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  24.56 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  27.05 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.41 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  24.13 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.1 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  24.37 
 
 
566 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.1 
 
 
597 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  25.94 
 
 
568 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  24.58 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  24.22 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>