More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2774 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 529 aa  1048    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.43 
 
 		 526 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  31.2 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.14 
 
 		 533 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.11 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.9 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  33.87 
 
 		 551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.94 
 
 		 523 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  31.51 
 
 		 557 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  31.73 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  30.66 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  32.63 
 
 		 523 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.88 
 
 		 548 aa  199  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  29.03 
 
 		 509 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  30.6 
 
 		 549 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  30.11 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.47 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.47 
 
 		 520 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  29.23 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  27.85 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.33 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  29.36 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.57 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.14 
 
 		 522 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  31.26 
 
 		 568 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.17 
 
 		 522 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.37 
 
 		 561 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.93 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.24 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28 
 
 		 596 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  29.26 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  28.62 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  27.16 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.63 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.18 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  27.27 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  28.1 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  27.75 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  25.52 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  25.52 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  25.52 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  25.14 
 
 		 571 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  24.77 
 
 		 571 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.91 
 
 		 567 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25.6 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.52 
 
 		 593 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.17 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.42 
 
 		 562 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.11 
 
 		 613 aa  126  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.27 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  26.86 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  27.87 
 
 		 566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  24.6 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  27.06 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.94 
 
 		 556 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  26.4 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  22.99 
 
 		 531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.85 
 
 		 550 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.86 
 
 		 472 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  22.24 
 
 		 523 aa  107  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.5 
 
 		 542 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.2 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 597 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.01 
 
 		 513 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.49 
 
 		 474 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.4 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.51 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.9 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.99 
 
 		 474 aa  94.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.94 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 475 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  23.11 
 
 		 501 aa  90.9  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.5 
 
 		 473 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.7 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  25.12 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.71 
 
 		 474 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  23.37 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.27 
 
 		 530 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1170 aa  87.4  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  23.93 
 
 		 575 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  19.66 
 
 		 581 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  22.78 
 
 		 486 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  23.17 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.22 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.03 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  22.38 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.42 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  23.83 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  24.47 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.35 
 
 		 575 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  23.24 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.33 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  22.93 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  22.93 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  22.84 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  22.84 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>