More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2731 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
548 aa  1076    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  52.92 
 
 
520 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  53.65 
 
 
520 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.64 
 
 
523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.37 
 
 
522 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.92 
 
 
519 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.74 
 
 
520 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  53.65 
 
 
520 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.83 
 
 
520 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.75 
 
 
522 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  52.01 
 
 
592 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.91 
 
 
522 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  45.41 
 
 
562 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  44.82 
 
 
545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  44.31 
 
 
568 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  44.6 
 
 
549 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  44.99 
 
 
561 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  42.09 
 
 
539 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.94 
 
 
522 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.76 
 
 
561 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  44.04 
 
 
536 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  41.55 
 
 
565 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  42.58 
 
 
561 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  36.89 
 
 
509 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  34.43 
 
 
523 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.21 
 
 
533 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.65 
 
 
565 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  29.31 
 
 
551 aa  216  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  31.41 
 
 
596 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.68 
 
 
551 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  33.85 
 
 
598 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  33.76 
 
 
557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.89 
 
 
526 aa  199  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.3 
 
 
557 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.44 
 
 
526 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  32.1 
 
 
529 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  36.43 
 
 
765 aa  191  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.85 
 
 
474 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.74 
 
 
474 aa  190  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  29.66 
 
 
551 aa  188  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.68 
 
 
473 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  30.41 
 
 
571 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  31.17 
 
 
531 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  30.18 
 
 
571 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  30.18 
 
 
571 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  30.18 
 
 
571 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  30.18 
 
 
571 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  32.6 
 
 
529 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  30.18 
 
 
571 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  31.76 
 
 
562 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.69 
 
 
613 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  30.55 
 
 
530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.91 
 
 
537 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  28.36 
 
 
569 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  29.58 
 
 
562 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  26.05 
 
 
532 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.56 
 
 
567 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  29.23 
 
 
565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.24 
 
 
542 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  28.54 
 
 
566 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 
530 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.08 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.23 
 
 
486 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.51 
 
 
550 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.12 
 
 
564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  27.86 
 
 
560 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.31 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.41 
 
 
505 aa  133  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.82 
 
 
581 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  27.79 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.97 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.09 
 
 
513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  26.83 
 
 
486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  27.35 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.4 
 
 
883 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.65 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.64 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25.52 
 
 
575 aa  110  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.3 
 
 
892 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.76 
 
 
529 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.77 
 
 
527 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.38 
 
 
527 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  26.98 
 
 
570 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  26.37 
 
 
556 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  25.48 
 
 
489 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.33 
 
 
526 aa  103  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.21 
 
 
523 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  28.32 
 
 
581 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.88 
 
 
597 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.32 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.96 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  24.11 
 
 
568 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.16 
 
 
474 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.83 
 
 
596 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.64 
 
 
498 aa  93.6  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  23.91 
 
 
587 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  24.36 
 
 
566 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.7 
 
 
484 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>