More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2710 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  100 
 
 
462 aa  895    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  37.15 
 
 
476 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  33.33 
 
 
490 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  32.68 
 
 
464 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  31.22 
 
 
474 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.51 
 
 
472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  29.18 
 
 
476 aa  159  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.81 
 
 
483 aa  156  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  29.15 
 
 
486 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  30.89 
 
 
459 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  30.15 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  29.85 
 
 
459 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.63 
 
 
500 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  30.41 
 
 
459 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.15 
 
 
461 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  30.09 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  28.69 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.39 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  30.59 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  29.87 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.93 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  28.94 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  30.47 
 
 
482 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
452 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.78 
 
 
486 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.88 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.11 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.51 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.29 
 
 
493 aa  120  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  28.19 
 
 
483 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  28.33 
 
 
478 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.98 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.56 
 
 
463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  28.14 
 
 
478 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.27 
 
 
515 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.61 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  27.33 
 
 
471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.37 
 
 
479 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  29 
 
 
508 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  30.26 
 
 
479 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  27.36 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  27.6 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  27.86 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  27.83 
 
 
511 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.61 
 
 
524 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.37 
 
 
492 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.78 
 
 
492 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  27.44 
 
 
507 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.81 
 
 
485 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.39 
 
 
475 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.57 
 
 
492 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  26.48 
 
 
446 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.65 
 
 
487 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.29 
 
 
492 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.49 
 
 
492 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 
492 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24.38 
 
 
489 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 
492 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  27.05 
 
 
487 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.79 
 
 
523 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.27 
 
 
493 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.27 
 
 
492 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.77 
 
 
484 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  27.81 
 
 
492 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.83 
 
 
489 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.64 
 
 
492 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 
492 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.62 
 
 
493 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.62 
 
 
493 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.64 
 
 
492 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.64 
 
 
492 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.64 
 
 
492 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.43 
 
 
492 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.43 
 
 
492 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.38 
 
 
489 aa  103  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26 
 
 
492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  26.11 
 
 
479 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.06 
 
 
488 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.64 
 
 
461 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.23 
 
 
482 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.73 
 
 
493 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  26.8 
 
 
495 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.16 
 
 
512 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.16 
 
 
512 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  28.09 
 
 
474 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  27.17 
 
 
499 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  23.65 
 
 
473 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
500 aa  96.7  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.98 
 
 
486 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  24.9 
 
 
639 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  27.38 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.25 
 
 
492 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.02 
 
 
518 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.45 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.55 
 
 
498 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.16 
 
 
491 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  23.85 
 
 
484 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  23.85 
 
 
484 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  23.85 
 
 
484 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.63 
 
 
459 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>