More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0846 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  89.26 
 
 		 508 aa  866    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  100 
 
 		 507 aa  989    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  64.31 
 
 		 497 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  53.63 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  50 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  49.57 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  48.53 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  48.84 
 
 		 463 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  46.5 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  47.27 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  46.69 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  46.53 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  45.15 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  46.32 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  47.9 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  46.09 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  47.15 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  38.45 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  34.9 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  29.01 
 
 		 483 aa  183  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  31.34 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  29.11 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.79 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.86 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.85 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.35 
 
 		 487 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.26 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.65 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.56 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  25.65 
 
 		 638 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  28.54 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  28.35 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  28.09 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  24.43 
 
 		 639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.97 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.75 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.75 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.04 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.72 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.22 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 505 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  24.8 
 
 		 633 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  27.43 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.48 
 
 		 507 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.12 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.05 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.11 
 
 		 479 aa  94.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  26.99 
 
 		 495 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 505 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 505 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23.89 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.43 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 531 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.14 
 
 		 517 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 475 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 523 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 479 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.76 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 		 537 aa  87  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  26.9 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.32 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  22.95 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.81 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  24.07 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.62 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  26.26 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4365  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.158425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.62 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  24.5 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.75 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  23.98 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  23.84 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  26.4 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.97 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  25.73 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  23.55 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  23.62 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.11 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>