197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0154 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  100 
 
 		 531 aa  1040    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  56.4 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.57 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.26 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.72 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  23.84 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  23.11 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.13 
 
 		 479 aa  88.6  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  21.22 
 
 		 463 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  21.46 
 
 		 463 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  20.49 
 
 		 462 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  23.33 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  21.96 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  22.12 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  22.12 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  22.12 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.79 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.47 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  21.67 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  23.54 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  20.17 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  24.82 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  26.74 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.18 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.78 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  23.53 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  19 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  20.78 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  24.72 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  21.09 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  21.49 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.73 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  21.35 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  22.99 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  23.88 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  22.29 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.25 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.63 
 
 		 542 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  22.33 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  20.83 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  24.12 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  20.05 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  24.03 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  19.72 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  21.71 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  19.57 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  22.66 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  20.18 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2448  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  21.26 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  22.58 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  24.63 
 
 		 489 aa  57  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  22.98 
 
 		 592 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  20.42 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  21.2 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  21.92 
 
 		 518 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  22.52 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  23.31 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  21.62 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  22.35 
 
 		 536 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  22.22 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  23.75 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  20.56 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  21.08 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  22.51 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  21.08 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  21.92 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.2 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  20.85 
 
 		 554 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  23.91 
 
 		 452 aa  54.3  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  24.14 
 
 		 529 aa  54.3  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.25 
 
 		 484 aa  54.3  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.11 
 
 		 567 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  21.68 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  21.78 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.63 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  22.63 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  20.63 
 
 		 554 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  20.6 
 
 		 639 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.43 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  22.03 
 
 		 530 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.24 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  21.65 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  24 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  20.55 
 
 		 516 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  22.25 
 
 		 511 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  21.29 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  22.1 
 
 		 529 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  23.52 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  23.86 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>