More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2448 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2448  Na+/solute symporter  100 
 
 		 490 aa  922    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0478  Na+/solute symporter  39.21 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  31.32 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  31.05 
 
 		 483 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  30.79 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  31.48 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  31.48 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  31.48 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  31.48 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  31.22 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  30.14 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  27.03 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.8 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  29.89 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  30.38 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  24.51 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  30 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  30 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  30 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  28.49 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.34 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  27.11 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  27.11 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  27.11 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  27.11 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  27.11 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.04 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  28.85 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  26.35 
 
 		 477 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.01 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  26.45 
 
 		 477 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  26.45 
 
 		 477 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  26.78 
 
 		 497 aa  93.6  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 483 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  26.65 
 
 		 477 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.77 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  25.59 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.77 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  26.05 
 
 		 477 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 482 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  25.74 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.12 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  25.12 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.73 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  25.85 
 
 		 499 aa  86.7  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.53 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24.88 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1943  Na+/solute symporter  29.3 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  28.41 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  27.38 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  24.43 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  28.41 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.47 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.54 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3847  sodium/proline symporter  25.17 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.63 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.71 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  26.46 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  26.12 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.3 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.87 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  25.87 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  23.62 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  27.82 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  25.86 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  24.31 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  23.72 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  22.77 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4283  sodium/proline symporter  25.34 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.86 
 
 		 533 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4236  sodium/proline symporter  25.34 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2384  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.96 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4423  sodium/proline symporter  25.34 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0117  sodium/proline symporter  25.34 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.96 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.17 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  23.62 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  23.57 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  25.62 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>