More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4423 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0083  sodium/proline symporter  91.75 
 
 
498 aa  837    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3013  sodium/proline symporter  84.54 
 
 
498 aa  803    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4236  sodium/proline symporter  99.8 
 
 
498 aa  986    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0117  sodium/proline symporter  100 
 
 
498 aa  989    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4423  sodium/proline symporter  100 
 
 
498 aa  989    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  85.34 
 
 
498 aa  833    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  75.56 
 
 
497 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3847  sodium/proline symporter  90.14 
 
 
498 aa  865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  89.94 
 
 
498 aa  866    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0764  sodium/proline symporter  88.35 
 
 
498 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  72.34 
 
 
504 aa  739    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  89.54 
 
 
498 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4283  sodium/proline symporter  99.8 
 
 
498 aa  988    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0492  sodium/proline symporter  66.87 
 
 
498 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  63.15 
 
 
495 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  58.81 
 
 
511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  60.08 
 
 
493 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  54.38 
 
 
492 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  57.76 
 
 
499 aa  535  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  54.38 
 
 
487 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  54.18 
 
 
492 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  54.69 
 
 
492 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  54.38 
 
 
493 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  54.38 
 
 
493 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  54.38 
 
 
493 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  54.38 
 
 
492 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  54.38 
 
 
492 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  53.97 
 
 
492 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  53.97 
 
 
492 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  57.02 
 
 
498 aa  525  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  57.14 
 
 
499 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  53.43 
 
 
541 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  54.66 
 
 
484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  54.81 
 
 
485 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  54.32 
 
 
492 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  52.23 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  52.23 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  52.23 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  52.23 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  52.23 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  52.23 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  54.03 
 
 
492 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  53.09 
 
 
492 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  52.51 
 
 
511 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  54.57 
 
 
492 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  51.4 
 
 
512 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  51.4 
 
 
512 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  53.39 
 
 
488 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  55.01 
 
 
496 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  53.39 
 
 
496 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  51.97 
 
 
486 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  48.57 
 
 
482 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  49.58 
 
 
493 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  50.42 
 
 
504 aa  457  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  49.68 
 
 
489 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  49.69 
 
 
488 aa  449  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  48.64 
 
 
489 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  48.43 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  50 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  47.93 
 
 
493 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  50.21 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  46.49 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  49.17 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  47.25 
 
 
495 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  47.42 
 
 
483 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  47.65 
 
 
483 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  48.85 
 
 
488 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  47.75 
 
 
494 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  48.68 
 
 
495 aa  430  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  47.17 
 
 
496 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  48.63 
 
 
486 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  47.13 
 
 
494 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  45.47 
 
 
499 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  47.51 
 
 
483 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  48.92 
 
 
482 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  49.56 
 
 
544 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  47.38 
 
 
495 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  47.58 
 
 
519 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  47.24 
 
 
492 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  49.4 
 
 
498 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  46.12 
 
 
499 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  47.81 
 
 
483 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  47.11 
 
 
506 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  46.95 
 
 
499 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  47.94 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  46.56 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  46.53 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  46.56 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  46.56 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  46.71 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  47.1 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  46.75 
 
 
483 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  46.75 
 
 
483 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  46.75 
 
 
483 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  46.12 
 
 
499 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  46.75 
 
 
483 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  46.93 
 
 
502 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  45.77 
 
 
492 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  45.97 
 
 
492 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  46.93 
 
 
502 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>