131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0688 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  100 
 
 
464 aa  889    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  40.48 
 
 
461 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  35.38 
 
 
459 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  34.24 
 
 
466 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  30.96 
 
 
472 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  30.02 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  29.79 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  29.79 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.07 
 
 
474 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  28.2 
 
 
471 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
472 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  28.44 
 
 
476 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  28.11 
 
 
463 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  27.76 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  27.7 
 
 
471 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  28.28 
 
 
473 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  25.59 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  29.88 
 
 
474 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.15 
 
 
483 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  26.85 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.93 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.17 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  22.94 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  23.7 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.49 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  25.36 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.67 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.67 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.15 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.8 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.76 
 
 
476 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  23.45 
 
 
446 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  22.93 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  22.57 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  21.14 
 
 
513 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.6 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  22.29 
 
 
531 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  23.91 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  22.6 
 
 
543 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  23.39 
 
 
516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.51 
 
 
516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.65 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.41 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  23.39 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.39 
 
 
516 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.39 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.39 
 
 
516 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.39 
 
 
516 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.23 
 
 
516 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0028  Na+/solute symporter  22.33 
 
 
530 aa  57  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00419856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  21.08 
 
 
520 aa  56.6  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.37 
 
 
484 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  21.39 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  24.16 
 
 
460 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.09 
 
 
461 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  25.44 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.79 
 
 
524 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.09 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  27.86 
 
 
498 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  40.51 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.8 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  30 
 
 
500 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  30 
 
 
573 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  34.11 
 
 
486 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  22.6 
 
 
508 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  31.86 
 
 
495 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  26.75 
 
 
603 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  20.29 
 
 
452 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.15 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  23.4 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  27.88 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  23.03 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.82 
 
 
493 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.15 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.15 
 
 
493 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  23.33 
 
 
674 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  28.81 
 
 
551 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  22.67 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  23.75 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.15 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.15 
 
 
492 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  31.85 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.15 
 
 
493 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.15 
 
 
493 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.15 
 
 
492 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.85 
 
 
522 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.33 
 
 
510 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  32.11 
 
 
614 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.18 
 
 
516 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.15 
 
 
487 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  23.48 
 
 
492 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0701  putative Na+/solute symporter  26.62 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.67 
 
 
482 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1068  Na+/solute symporter  29.82 
 
 
580 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  22.74 
 
 
487 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>