More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5962 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  100 
 
 		 472 aa  928    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  94.7 
 
 		 472 aa  891    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  80.13 
 
 		 476 aa  740    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  94.92 
 
 		 472 aa  894    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  94.92 
 
 		 472 aa  894    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  60.9 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  61.85 
 
 		 472 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  57.26 
 
 		 473 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  60.26 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  59.82 
 
 		 471 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  59.75 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  37.87 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  36.71 
 
 		 472 aa  289  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.18 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.33 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  30.96 
 
 		 464 aa  113  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 459 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.15 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.43 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.19 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.94 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.18 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.88 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.13 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  22.65 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.77 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.77 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.82 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.55 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.1 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.4 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.64 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.15 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.05 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.86 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.05 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.05 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.78 
 
 		 592 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.55 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.93 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.07 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.11 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.66 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.73 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.92 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  22.85 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  22.72 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.94 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.24 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  21.98 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.95 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.82 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.03 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.52 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  22.28 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  27.85 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1170 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  21.72 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  25 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  22.36 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.63 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  21.6 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  22.88 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.23 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.54 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  24.54 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  21.28 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  22.86 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  25.26 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  21.96 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.92 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  24.35 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  24.31 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  24.51 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  28.1 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.27 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>