More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0028 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0028  Na+/solute symporter  100 
 
 		 530 aa  1051    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00419856  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.61 
 
 		 482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1068  Na+/solute symporter  27.9 
 
 		 580 aa  136  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.26 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.31 
 
 		 497 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  26.41 
 
 		 477 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.42 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  25.97 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  26.36 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0769  Na+/solute symporter  24.8 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  26.3 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.45 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  26.65 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.2 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.08 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  25.67 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  26.51 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  23.5 
 
 		 480 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  23.16 
 
 		 483 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 525 aa  100  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.43 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  23.89 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  25.87 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  24.38 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.55 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  23.99 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  24.72 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  25.44 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24 
 
 		 489 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.15 
 
 		 488 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4365  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 554 aa  93.6  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.158425  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  23.75 
 
 		 489 aa  93.6  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 507 aa  93.2  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  24.69 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  22.56 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  21.88 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.52 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  24.58 
 
 		 483 aa  90.5  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  23.01 
 
 		 495 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.15 
 
 		 513 aa  90.1  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  22.83 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.83 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.83 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  24.61 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.92 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  22.83 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  21.89 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  22.83 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.53 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  22.83 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.31 
 
 		 483 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  22.57 
 
 		 483 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  24.55 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  22.78 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  23.65 
 
 		 499 aa  87.4  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  22.98 
 
 		 482 aa  87.4  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  22.36 
 
 		 483 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  23.61 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  23.15 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  22.61 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.73 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  22.29 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  23.11 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  23.14 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.11 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  23.58 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  22.69 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  22.29 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  22.69 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  22.27 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  22.69 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.84 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  22.45 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  22.4 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  23.76 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.37 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  23.47 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  21.48 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  22.73 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  23.4 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  25.75 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  22.13 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  22.13 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  22.08 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  22.13 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  22.13 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  22.72 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  22.94 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  22.7 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  22.78 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  22.78 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  22.78 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>