More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1068 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1068  Na+/solute symporter  100 
 
 		 580 aa  1132    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0028  Na+/solute symporter  28.18 
 
 		 530 aa  140  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00419856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0769  Na+/solute symporter  25.2 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  24.46 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  27.16 
 
 		 477 aa  93.6  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.1 
 
 		 524 aa  92.8  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 527 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.06 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  26.4 
 
 		 502 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  24.56 
 
 		 526 aa  87.8  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  27.56 
 
 		 544 aa  87  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  25.49 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  23.11 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.1 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.71 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  27.95 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  24.51 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.15 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  23.54 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  25.87 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  24.49 
 
 		 591 aa  80.5  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  24.71 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.57 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  25.35 
 
 		 552 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  24.1 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.28 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.38 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.57 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.57 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.38 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  25.62 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  26.2 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.57 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  26.81 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  24.12 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  24.61 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  25.41 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.39 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.38 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  25.31 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.71 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  26.31 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  21.74 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.55 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  24.71 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  27.43 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  25.41 
 
 		 568 aa  76.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  22.96 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  23.96 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.54 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  25.52 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  27.54 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  23.84 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  23.96 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1079  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  25.8 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  23.48 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.14 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.23 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  25.56 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  22.96 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  24.9 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  26.36 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.95 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  24.9 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  24.9 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  22.2 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  24.9 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  26.36 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  24.9 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  23.64 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  26.36 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  26.36 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.86 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4365  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 554 aa  73.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.158425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  23.67 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  23.98 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  23.98 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  23.98 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  23.45 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  23.98 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  23.99 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  26.62 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  25.88 
 
 		 498 aa  72.8  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  26.16 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.86 
 
 		 533 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  25.4 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  23.54 
 
 		 562 aa  72  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>