More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1079 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1079  Na+/solute symporter  100 
 
 
501 aa  993    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2384  Na+/solute symporter  38.46 
 
 
481 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.97 
 
 
510 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  24.12 
 
 
511 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  28.16 
 
 
487 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  24.49 
 
 
495 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.3 
 
 
485 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.8 
 
 
498 aa  99  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.25 
 
 
497 aa  96.7  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  25.62 
 
 
491 aa  96.3  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.32 
 
 
489 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.56 
 
 
518 aa  94  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.23 
 
 
489 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  26.2 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.45 
 
 
512 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.45 
 
 
512 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  24.6 
 
 
504 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  23.64 
 
 
489 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  25.79 
 
 
483 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.1 
 
 
493 aa  90.5  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  23.39 
 
 
492 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.53 
 
 
482 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.54 
 
 
493 aa  89  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.59 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  26.32 
 
 
496 aa  88.2  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.44 
 
 
484 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.57 
 
 
544 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  25.31 
 
 
495 aa  87  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  24.94 
 
 
506 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.58 
 
 
486 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  24.84 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  25.7 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  23.61 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.77 
 
 
500 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  22.93 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.39 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.43 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  23.25 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.03 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  23.4 
 
 
504 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.16 
 
 
487 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  24.6 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  22.8 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.39 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  24.77 
 
 
481 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  26.76 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  22.94 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  23.46 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  23.02 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.16 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.02 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.16 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.02 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  23.02 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.16 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  23.02 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.16 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.02 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  22.65 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  23.44 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.16 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3847  sodium/proline symporter  25.16 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  23.38 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3013  sodium/proline symporter  24.26 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  24.09 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  23.58 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  25.59 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.19 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  24.95 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.18 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  23.11 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.89 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  25.29 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  25.94 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.37 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  23.2 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  24.8 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  24.53 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  24.53 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  24.53 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  24.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.67 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.93 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29910  sodium/proline symporter  26.05 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  24.04 
 
 
483 aa  77  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  26.5 
 
 
477 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  24.5 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27.49 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.04 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  24.72 
 
 
492 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  22.88 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  22.34 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  23.59 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>