More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3921 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  74.95 
 
 		 459 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  75.59 
 
 		 459 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  77.27 
 
 		 459 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  74.3 
 
 		 459 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  74.73 
 
 		 459 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  99.14 
 
 		 463 aa  898    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  100 
 
 		 463 aa  902    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  71.59 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  62.33 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  56.64 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  57.11 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  57.4 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  51.87 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  50 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  49.25 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  48.84 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  48.84 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  43.21 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  40.13 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  33.97 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.91 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  29.98 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  30.64 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.77 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.97 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.85 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.26 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  30.04 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  28.95 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  28.73 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  29.3 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  29.3 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.35 
 
 		 486 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  29.37 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 551 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  29.61 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.98 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.22 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.54 
 
 		 485 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.16 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.29 
 
 		 523 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.93 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.4 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.4 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.48 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.4 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.82 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  30.23 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.63 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.54 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  27.4 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.31 
 
 		 493 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.2 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.2 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.81 
 
 		 533 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.7 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.14 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.52 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.52 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.52 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.52 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.7 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.99 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.31 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.31 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  24.78 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.41 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.48 
 
 		 479 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.75 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  27.19 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  24.31 
 
 		 639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  23.64 
 
 		 638 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  27.02 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.46 
 
 		 484 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.47 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.89 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  26.84 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.73 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.84 
 
 		 527 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  28.53 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.81 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.85 
 
 		 517 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.16 
 
 		 486 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.9 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.12 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>