More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0212 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  100 
 
 		 475 aa  932    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  60.84 
 
 		 486 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  55.39 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  55.77 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  54.49 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  53.42 
 
 		 478 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  53.21 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  54.7 
 
 		 479 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  49.58 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  49.79 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  50.73 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  50.74 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  50 
 
 		 482 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  51.54 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  48.02 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  38.56 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  37.94 
 
 		 460 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  35.96 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  30.39 
 
 		 460 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.14 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.84 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  27.65 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.75 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.96 
 
 		 459 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.41 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.03 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.29 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.47 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.31 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.63 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 510 aa  97.1  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  26.08 
 
 		 741 aa  96.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.87 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.87 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.87 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.73 
 
 		 479 aa  93.6  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.98 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 505 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  25.59 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.33 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  23.01 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 527 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  22.72 
 
 		 459 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  26.07 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  23.84 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.82 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.47 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.14 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.11 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.55 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.15 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.46 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.84 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  28.95 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.54 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.44 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  25.71 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4604  sodium/proline symporter  25.28 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  24.53 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.82 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  24.23 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  24.23 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  22.25 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.93 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.74 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.56 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  25.49 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  24.05 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  25.67 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.58 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.96 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.67 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.67 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  25.67 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  24.45 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>