More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6955 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  94.7 
 
 		 472 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  99.79 
 
 		 472 aa  921    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  100 
 
 		 472 aa  922    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  99.79 
 
 		 472 aa  921    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  78.81 
 
 		 476 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  59.83 
 
 		 471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  61.21 
 
 		 472 aa  579  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  57.48 
 
 		 473 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  57.96 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  58.72 
 
 		 471 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  60.38 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  36.49 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.09 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  30.02 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  28.64 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.94 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.67 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.95 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.9 
 
 		 519 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.65 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.69 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.43 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.18 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.74 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.01 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.78 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.51 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  22.61 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.46 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.08 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.46 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.59 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  24.53 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.63 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.11 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.53 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.31 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  21.83 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.91 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  22.66 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  26.18 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.23 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.16 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.27 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.28 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.07 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.63 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.59 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.84 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  21.88 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  25.13 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.13 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1170 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  23.53 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  25.16 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  21.75 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  23.01 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  26.37 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  23.06 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  25.46 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.8 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.57 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.34 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.35 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.11 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.35 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  22.73 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  21.81 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>