More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1533 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  94.92 
 
 		 472 aa  894    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  100 
 
 		 472 aa  924    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  99.79 
 
 		 472 aa  921    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  79.03 
 
 		 476 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  100 
 
 		 472 aa  924    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  60.04 
 
 		 471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  61.42 
 
 		 472 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  57.69 
 
 		 473 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  58.17 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  60.59 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  58.94 
 
 		 471 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  36.49 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.09 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  29.79 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  28.98 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.19 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.67 
 
 		 472 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 449 aa  93.2  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.35 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.94 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.9 
 
 		 519 aa  87.4  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.05 
 
 		 520 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.74 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.2 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.18 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.78 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.86 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.51 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.46 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.59 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  24.53 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.46 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  22.61 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.83 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.79 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  22.07 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.11 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.63 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.07 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.23 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.91 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  22.4 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.16 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.27 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.01 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.07 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.82 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.59 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  24.87 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  21.88 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.78 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  23.33 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1170 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  26.37 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.8 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.78 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  21.75 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.76 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.84 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  23.06 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  25.46 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  21.81 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.57 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.35 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.35 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  22.73 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>