More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0563 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  100 
 
 		 476 aa  933    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  78.81 
 
 		 472 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  79.03 
 
 		 472 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  79.03 
 
 		 472 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  80.13 
 
 		 472 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  60.9 
 
 		 471 aa  601  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  60.93 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  62.16 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  57.69 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  58.32 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  58.1 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  35.84 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  33.98 
 
 		 472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  28.64 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.44 
 
 		 475 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.11 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  28.95 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  28.44 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.77 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.37 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.63 
 
 		 523 aa  90.5  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.38 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.09 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25 
 
 		 592 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.3 
 
 		 519 aa  87.8  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.26 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.14 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.14 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.42 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.28 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.01 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.38 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  22.17 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.86 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.33 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.24 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.41 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.45 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.9 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.69 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.29 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.12 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.48 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.07 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.44 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  22.71 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.86 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.16 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  22.48 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.19 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.06 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.94 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.91 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.48 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  25.13 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  21.72 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.48 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.77 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.48 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.48 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.48 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.48 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.52 
 
 		 567 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.48 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.11 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.51 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.48 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  24.31 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.55 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>