More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5240 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  100 
 
 		 460 aa  919    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  59.69 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  43.6 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  42.95 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  41.99 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  41.77 
 
 		 478 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  41.72 
 
 		 479 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  40.53 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  43.13 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  43.35 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  41.59 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  41.59 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  41.87 
 
 		 479 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  40.56 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  37.63 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  38.2 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  36.89 
 
 		 495 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  38.46 
 
 		 475 aa  292  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  30.84 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.65 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.68 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  28.5 
 
 		 507 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.9 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.64 
 
 		 474 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.9 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.58 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  28.79 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.81 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  28.79 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  28.82 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.9 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.02 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.81 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.79 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  29.66 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  24.51 
 
 		 466 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 527 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25.29 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.65 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 462 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.11 
 
 		 506 aa  96.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.04 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.99 
 
 		 508 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.14 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25 
 
 		 486 aa  93.6  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.4 
 
 		 523 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  26.31 
 
 		 497 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  26.42 
 
 		 494 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 507 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.57 
 
 		 492 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.88 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.26 
 
 		 482 aa  90.5  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.94 
 
 		 476 aa  90.1  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.59 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.78 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  25.53 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.63 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.78 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.55 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  25.81 
 
 		 494 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.78 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.78 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.43 
 
 		 530 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.69 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.85 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  25.54 
 
 		 511 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.16 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.32 
 
 		 482 aa  87  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 478 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.67 
 
 		 489 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.82 
 
 		 482 aa  86.7  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.17 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.69 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.62 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.46 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  25.3 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.46 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.51 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>