More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00590 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  100 
 
 
460 aa  889    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  33.85 
 
 
474 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  30.55 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  30.99 
 
 
461 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  32.83 
 
 
459 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  32.39 
 
 
459 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  32.1 
 
 
459 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  32.1 
 
 
459 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  31.51 
 
 
463 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  31.07 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  31.16 
 
 
483 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  31.24 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.76 
 
 
472 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  32.97 
 
 
479 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  32.31 
 
 
463 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  30.43 
 
 
464 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  30.23 
 
 
462 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  29.93 
 
 
508 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  32.07 
 
 
460 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  30.84 
 
 
476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  30.79 
 
 
507 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  31.23 
 
 
483 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  30.19 
 
 
500 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.57 
 
 
482 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
483 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  30.62 
 
 
487 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  29.44 
 
 
479 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  29.93 
 
 
486 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  30.32 
 
 
506 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  28.22 
 
 
483 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  29.7 
 
 
475 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.99 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.06 
 
 
484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  27.21 
 
 
461 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  28.15 
 
 
478 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  29.87 
 
 
462 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  27.36 
 
 
478 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  27.98 
 
 
479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  27.85 
 
 
471 aa  140  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  30.05 
 
 
496 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  30.91 
 
 
449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.36 
 
 
490 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  28.69 
 
 
492 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.85 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  27.11 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  28.36 
 
 
500 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.01 
 
 
524 aa  130  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  26.88 
 
 
479 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
515 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.47 
 
 
523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.66 
 
 
466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.52 
 
 
526 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.79 
 
 
493 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  29.79 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  28 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.17 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.52 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  30.35 
 
 
509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.36 
 
 
510 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.46 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  27.31 
 
 
639 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  27.68 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  26.77 
 
 
495 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.06 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  26.45 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  26 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.05 
 
 
486 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.35 
 
 
492 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.01 
 
 
483 aa  113  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.63 
 
 
497 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.97 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.05 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  28.53 
 
 
577 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.78 
 
 
460 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.56 
 
 
513 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 
452 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.09 
 
 
492 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.95 
 
 
493 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.23 
 
 
483 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.67 
 
 
482 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.53 
 
 
518 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  28.54 
 
 
542 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.33 
 
 
483 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.19 
 
 
496 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.52 
 
 
483 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.97 
 
 
484 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  26.67 
 
 
476 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.29 
 
 
486 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  27.77 
 
 
495 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.62 
 
 
492 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  26.65 
 
 
483 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.29 
 
 
483 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.29 
 
 
483 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.05 
 
 
492 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.29 
 
 
483 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.29 
 
 
483 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  26.29 
 
 
527 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.29 
 
 
483 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25 
 
 
517 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>