106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2834 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  100 
 
 		 543 aa  1074    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  56.4 
 
 		 531 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.08 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.03 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.03 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  22.81 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  22.37 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.75 
 
 		 479 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.92 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 475 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  22.37 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  22.07 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  21.26 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  21.26 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  23.77 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  21.85 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  19.87 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  22.36 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.24 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.19 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.98 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  22.39 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  22.59 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  21.81 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  20.37 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  24.92 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  20.73 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.58 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  22.6 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  20.2 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.21 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  22.44 
 
 		 562 aa  60.1  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  20.18 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  25.45 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  21.58 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  22.25 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 472 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 472 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  22.57 
 
 		 543 aa  57  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.01 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  21.6 
 
 		 476 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.59 
 
 		 489 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  20.92 
 
 		 460 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.52 
 
 		 510 aa  54.7  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 489 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.25 
 
 		 493 aa  54.3  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  20.29 
 
 		 479 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  22.9 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.7 
 
 		 526 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  22.38 
 
 		 639 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  21 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  24.89 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  22.39 
 
 		 592 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  21.94 
 
 		 527 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 533 aa  51.2  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 472 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2448  Na+/solute symporter  24.43 
 
 		 490 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  19.63 
 
 		 482 aa  50.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  22.06 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  21.54 
 
 		 571 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  20.12 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  21.59 
 
 		 530 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  24.09 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  21.11 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  21.11 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  21.11 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  20.79 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  21.11 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  23.4 
 
 		 553 aa  48.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  23.46 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  21.61 
 
 		 571 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  24.33 
 
 		 526 aa  47  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.92 
 
 		 520 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.39 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  19.3 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  21.84 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  19.3 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  20.04 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  23.1 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  21.12 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  24.49 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 476 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  21.72 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  19.53 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  25.1 
 
 		 467 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  21.72 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  21.72 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  26.99 
 
 		 531 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  20.87 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  21.72 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  19.86 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  22.03 
 
 		 581 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  21.81 
 
 		 596 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.57 
 
 		 551 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>