More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2072 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  100 
 
 		 609 aa  1219    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  61.25 
 
 		 594 aa  744    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  67.91 
 
 		 593 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  33.91 
 
 		 596 aa  290  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  32.18 
 
 		 625 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  32.2 
 
 		 625 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  32.84 
 
 		 596 aa  276  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  30.31 
 
 		 577 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 588 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 599 aa  161  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 603 aa  160  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  26.59 
 
 		 586 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  28.88 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  26.16 
 
 		 588 aa  151  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 587 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  25.32 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  27.02 
 
 		 538 aa  145  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  27.45 
 
 		 583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  27.45 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.7 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.81 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.74 
 
 		 575 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  27.43 
 
 		 609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  25.31 
 
 		 587 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.43 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.99 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.15 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.09 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.49 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 		 492 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.49 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.9 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.9 
 
 		 492 aa  111  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.9 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.9 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.9 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.37 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.22 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  27.43 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.21 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.1 
 
 		 492 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.9 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.77 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.63 
 
 		 533 aa  100  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  27 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 498 aa  98.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.3 
 
 		 492 aa  98.2  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.1 
 
 		 483 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 		 492 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.27 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.47 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.3 
 
 		 485 aa  96.3  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.23 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.55 
 
 		 484 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.71 
 
 		 484 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.53 
 
 		 492 aa  93.6  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  24.2 
 
 		 511 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.02 
 
 		 522 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.2 
 
 		 509 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.28 
 
 		 520 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.69 
 
 		 487 aa  92  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.65 
 
 		 493 aa  91.3  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.22 
 
 		 497 aa  91.3  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 495 aa  90.9  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.02 
 
 		 520 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.11 
 
 		 592 aa  90.5  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.92 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  25.16 
 
 		 598 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.83 
 
 		 557 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.19 
 
 		 518 aa  89  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.99 
 
 		 526 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.44 
 
 		 495 aa  87.4  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.48 
 
 		 548 aa  87  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  23.7 
 
 		 488 aa  87  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  24.24 
 
 		 498 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.37 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  23.19 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.5 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  25.15 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.65 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  25.04 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.78 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.78 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  25.62 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.04 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.71 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.63 
 
 		 557 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.65 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.15 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.95 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.67 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>