More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1358 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  100 
 
 		 587 aa  1173    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  74.79 
 
 		 585 aa  895    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  72.28 
 
 		 588 aa  893    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  75.64 
 
 		 587 aa  897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  74.96 
 
 		 586 aa  910    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  74.49 
 
 		 588 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  79.22 
 
 		 587 aa  928    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  45.63 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  50 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  43.17 
 
 		 575 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  37.11 
 
 		 603 aa  363  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  39.3 
 
 		 577 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  33.22 
 
 		 583 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  32.88 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  34.27 
 
 		 587 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  33.82 
 
 		 584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.76 
 
 		 587 aa  260  6e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  34.57 
 
 		 589 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  29.61 
 
 		 538 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 596 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 625 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  28.88 
 
 		 609 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  26.19 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 594 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 597 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 593 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.8 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.38 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.26 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 523 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.02 
 
 		 526 aa  103  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  27.91 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.24 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.99 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.47 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.87 
 
 		 519 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  25.81 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 570 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.41 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  23.72 
 
 		 604 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  26.15 
 
 		 575 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 529 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 483 aa  97.1  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.96 
 
 		 459 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.03 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.16 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.82 
 
 		 462 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.18 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.96 
 
 		 497 aa  94  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.41 
 
 		 548 aa  93.6  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  26.39 
 
 		 581 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  22.82 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.36 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.99 
 
 		 482 aa  90.5  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 511 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.85 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.2 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.49 
 
 		 533 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 633 aa  89.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.22 
 
 		 565 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.63 
 
 		 513 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 488 aa  87.8  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.46 
 
 		 463 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.51 
 
 		 495 aa  87.4  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  29.46 
 
 		 463 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.1 
 
 		 493 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  25.12 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.82 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  23.98 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24.9 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.08 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  28.65 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  24.88 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.9 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.39 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.17 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  24.42 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  25.3 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.81 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.9 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.09 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  25.41 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  23.96 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  22.7 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.7 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  24.17 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4604  sodium/proline symporter  26.54 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.2 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.65 
 
 		 593 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>