More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1083 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  79.42 
 
 		 586 aa  956    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  76.36 
 
 		 585 aa  926    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  80.44 
 
 		 587 aa  941    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  76.87 
 
 		 588 aa  923    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  74.49 
 
 		 587 aa  877    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  100 
 
 		 588 aa  1175    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  75.85 
 
 		 587 aa  901    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  50.88 
 
 		 609 aa  535  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  46.15 
 
 		 599 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  41.58 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  36.33 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  37.76 
 
 		 577 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  33 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  32.83 
 
 		 583 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.85 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  32.69 
 
 		 587 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  37.01 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  32.82 
 
 		 589 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  30.3 
 
 		 538 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 596 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 609 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  26.93 
 
 		 594 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 625 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 593 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  24.33 
 
 		 625 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.54 
 
 		 556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.04 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.03 
 
 		 523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.3 
 
 		 526 aa  109  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.7 
 
 		 592 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.04 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.24 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 604 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  25.79 
 
 		 575 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.1 
 
 		 479 aa  97.4  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 520 aa  97.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  25.76 
 
 		 570 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.42 
 
 		 533 aa  94  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.27 
 
 		 548 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.74 
 
 		 520 aa  90.9  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  24.67 
 
 		 484 aa  90.1  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.13 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.73 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  26.44 
 
 		 590 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.18 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.14 
 
 		 523 aa  88.6  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.34 
 
 		 509 aa  88.2  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.66 
 
 		 551 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.67 
 
 		 459 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.65 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.88 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.83 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.89 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.17 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  24.3 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.5 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  24.62 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.75 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.24 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.81 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  25 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.59 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  24.31 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 533 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.15 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.73 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.23 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.56 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.73 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  24.48 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.87 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  23.29 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.56 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.78 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.69 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.14 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.07 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.45 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.94 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.46 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.64 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  21.53 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  24.47 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.04 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  23.9 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  20.99 
 
 		 569 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.08 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.88 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 		 598 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.68 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.9 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  23.45 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24.07 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>