More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2245 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  100 
 
 		 609 aa  1184    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  50 
 
 		 588 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  50.92 
 
 		 585 aa  585  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  50.08 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  49.17 
 
 		 588 aa  568  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  51.82 
 
 		 587 aa  569  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  50.58 
 
 		 587 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  49.67 
 
 		 587 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  46.55 
 
 		 599 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  40.26 
 
 		 575 aa  425  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  39.05 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  42.04 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  36.48 
 
 		 583 aa  320  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  36.59 
 
 		 583 aa  317  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  41.11 
 
 		 587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  39.39 
 
 		 584 aa  303  8.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  36.57 
 
 		 587 aa  297  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  37.8 
 
 		 589 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  31.32 
 
 		 538 aa  207  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 596 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.43 
 
 		 609 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  26.23 
 
 		 596 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  25.3 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 597 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.68 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  27.53 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.08 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.76 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.65 
 
 		 548 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.1 
 
 		 592 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.19 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.12 
 
 		 520 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.1 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.17 
 
 		 522 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.75 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.79 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.7 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.32 
 
 		 526 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.47 
 
 		 520 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.38 
 
 		 479 aa  98.2  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.75 
 
 		 522 aa  97.8  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.05 
 
 		 551 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.2 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  21.91 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.05 
 
 		 522 aa  94.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  25.61 
 
 		 604 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.29 
 
 		 526 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  23.56 
 
 		 570 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.14 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.79 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.64 
 
 		 565 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  26.44 
 
 		 529 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.48 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  25.17 
 
 		 590 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  22.66 
 
 		 545 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.67 
 
 		 520 aa  87.8  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.58 
 
 		 463 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  27.54 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  25.18 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.5 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.37 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.89 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.56 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.86 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  22.38 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  22.89 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.58 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.32 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.65 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 590 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.57 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  22.66 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.49 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.42 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  25.88 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  25.22 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.68 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.5 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  22.37 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.97 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.23 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25.9 
 
 		 460 aa  73.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.65 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.43 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>