188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3029 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  100 
 
 		 492 aa  979    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  62.15 
 
 		 501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  54.23 
 
 		 487 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  54.87 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  50.52 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  48.65 
 
 		 478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  47.66 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  42.68 
 
 		 486 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  28.64 
 
 		 501 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.11 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  25.82 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  25.83 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  25.63 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 489 aa  120  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.23 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  25.97 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  23.69 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  24.65 
 
 		 523 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.48 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.67 
 
 		 574 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 568 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  26.98 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.82 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 		 530 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.47 
 
 		 513 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  24.82 
 
 		 502 aa  99.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.4 
 
 		 513 aa  94  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.09 
 
 		 892 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.32 
 
 		 527 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  25.71 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  24.76 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.13 
 
 		 581 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.97 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.06 
 
 		 505 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  24.38 
 
 		 562 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  23.84 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.1 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.66 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.66 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.66 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.66 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.49 
 
 		 581 aa  80.1  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  22.59 
 
 		 883 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  22.9 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.76 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.76 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.82 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.32 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  21.3 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.27 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  20.79 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  24.01 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  21.04 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.54 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.68 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.48 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.37 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  20.19 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.82 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  27.5 
 
 		 570 aa  71.2  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  22.84 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.4 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.06 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.49 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.97 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  25.6 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.87 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.3 
 
 		 613 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.99 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  22.73 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.08 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  22.38 
 
 		 575 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.68 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  23.62 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  23.24 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.64 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.33 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.22 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.61 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.38 
 
 		 526 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  23.04 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 		 567 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  21.09 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  21.39 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  21.04 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  23.75 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  22.07 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  21.15 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  22.07 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  22.07 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.46 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>